Cercetările au constatat că somnul insuficient este asociat unui risc crescut de apariție a diabetului zaharat de tip 2. Mai exact, durata și calitatea somnului au fost descriși      ca predictori ai nivelurilor de hemoglobină A1c, un marker important al controlului glicemiei. Cercetări recente sugerează că optimizarea duratei și calității somnului poate reprezenta un mijloc important de îmbunătățire a controlului glicemiei la persoanele cu diabet zaharat de tip 2.

S-a constatat că persoanele cu apnee în somn prezintă un risc crescut pentru o serie de boli cardiovasculare. În special, s-a constatat că hipertensiunea, accidentul vascular cerebral, bolile coronariene și bătăile neregulate ale inimii (aritmii cardiace) sunt mai frecvente în rândul persoanelor cu somn dezordonat decât în rândul celor fără anomalii ale somnului. De asemenea, apneea în somn și rigidizarea arterelor / ateroscleroza par să împărtășească unele caracteristici fiziologice comune, sugerând în plus că apneea în somn poate fi un predictor important al bolilor cardiovasculare.

Cercetările de laborator au constatat că durata scurtă a somnului duce la modificări metabolice care pot fi legate de obezitate. Studiile epidemiologice efectuate în comunitate au arătat, de asemenea, o asociere între o durată scurtă a somnului și excesul de greutate corporală. Această asociere a fost raportată la toate grupele de vârstă,      dar a fost deosebit de accentuată la copii. Se crede că somnul în copilărie și adolescență este deosebit de important pentru dezvoltarea creierului și că somnul insuficient la tineri poate afecta negativ funcția unei regiuni a creierului cunoscute sub numele de hipotalamus, care reglează apetitul și consumul de energie.

Relația dintre somn și depresie este una complexă. Cu toate că tulburările de somn au fost considerate vreme îndelungată a fi un simptom important al depresiei, cercetările recente au indicat că simptomele depresiei pot scădea odată ce apneea în somn este tratată în mod eficient și se restabilește un somn suficient. Interdependența dintre somn și depresie sugerează că este important să se evalueze somnul suficient la persoanele cu depresie și să se monitorizeze simptomele de depresie în rândul persoanelor cu tulburări de somn.